海关总署是国内较早推广使用电子保函的政府部门，率先明确规定了电子保函业务，并成功地与金融机构合作开展了电子保函服务，开展在京津冀、长江经济带和广东地区区域通关一体化改革，在区域内海关推动电子保函“一关备案、区域通用”改革试点，打破关区界限，降低通关成本，促进贸易便利化。
住房和城乡建设部是工程担保业务的主管部门，近年来也加快了推进电子保函的力度。2018年7月2日，住建部官网发布《关于加快推进实施工程担保制度的指导意见（征求意见稿）》，在创新监督管理方式方面明确提出：“引导各方市场主体树立信用意识，加强内部信用管理，不断提高履约能力，积累企业信用。修订保函示范文本，修改完善工程招标文件和合同示范文本，推进工程担保应用；积极发展电子保函，鼓励以工程再担保体系增强对担保机构的信用管理，推进“互联网+”工程担保市场监管。”
预付保函又称还款保函（repayment guarantee）及退款保函，在贸易合同中还可以称为定金保函（down-payment guarantee）。在大额交易中，买方或业主在合约签订后的一定时间内预先需向供货方支付一定比例的款项作为执行合同的启动资金，由于该款项是对供货方在履约之前所作的预付，买方为了避免日后由于供货方拒绝履行义务或者无法履行义务，却不退款而无端遭到损失，通常要求供货方在买方预付之前的若干日内通过其银行开出预付保函，由银行作出承诺，一旦申请人未能履约或者是无法全部履约（不管这种行为是有意的或者是无意造成的），担保行将在收到买方提出的索赔后，向其返还这笔与预付金额等值的款项，或者相当于合约尚未履行部分相当比例的预付金额，使买方能够顺利的收回所预付的款项。
发行主体：
- 银行保函：银行保函由银行作为发行主体，因其信誉稳定且具备一定的监管体系，在国际贸易中得到广泛认可。银行保函往往具有较高的可靠性和可信度。
- 商业保函：商业保函可以由各类非金融机构或保险公司发行，这些发行主体根据市场需求和风险评估来提供保函服务。商业保函的可靠性因发行主体的不同而有差异。